Protein–RNA interactions for Protein: Q01454

CTF4, DNA polymerase alpha-binding protein, yeastyeast

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Length 927 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF4Q01454 YCL074WYCL074W 927 nt12.58□□□□□ -0.4
CTF4Q01454 PRO1YDR300C 1287 nt12.57□□□□□ -0.4
CTF4Q01454 YML089CYML089C 369 nt12.56□□□□□ -0.4
CTF4Q01454 TSC10YBR265W 963 nt12.56□□□□□ -0.4
CTF4Q01454 HIP1YGR191W 1812 nt12.55□□□□□ -0.4
CTF4Q01454 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.54□□□□□ -0.4
CTF4Q01454 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.54□□□□□ -0.4
CTF4Q01454 ATG15YCR068W 1563 nt12.54□□□□□ -0.4
CTF4Q01454 YGR012WYGR012W 1182 nt12.53□□□□□ -0.4
CTF4Q01454 LSC2YGR244C 1284 nt12.52□□□□□ -0.41
CTF4Q01454 MET28YIR017C 564 nt12.5□□□□□ -0.41
CTF4Q01454 NVJ2YPR091C 2313 nt12.46□□□□□ -0.41
CTF4Q01454 PAC11YDR488C 1602 nt12.45□□□□□ -0.42
CTF4Q01454 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt12.45□□□□□ -0.42
CTF4Q01454 TIF6YPR016C 738 nt12.45□□□□□ -0.42
CTF4Q01454 RIB3YDR487C 627 nt12.43□□□□□ -0.42
CTF4Q01454 CAB5YDR196C 726 nt12.4□□□□□ -0.42
CTF4Q01454 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt12.39□□□□□ -0.43
CTF4Q01454 GAP1YKR039W 1809 nt12.39□□□□□ -0.43
CTF4Q01454 YLR279WYLR279W 390 nt12.38□□□□□ -0.43
CTF4Q01454 FIT3YOR383C 615 nt12.37□□□□□ -0.43
CTF4Q01454 ARP6YLR085C 1317 nt12.37□□□□□ -0.43
CTF4Q01454 FUR4YBR021W 1902 nt12.36□□□□□ -0.43
CTF4Q01454 MSB4YOL112W 1479 nt12.33□□□□□ -0.44
CTF4Q01454 RTN2YDL204W 1182 nt12.32□□□□□ -0.44
CTF4Q01454 RAD51YER095W 1203 nt12.32□□□□□ -0.44
CTF4Q01454 STE4YOR212W 1272 nt12.32□□□□□ -0.44
CTF4Q01454 PLB1YMR008C 1995 nt12.3□□□□□ -0.44
CTF4Q01454 YJL195CYJL195C 702 nt12.28□□□□□ -0.44
CTF4Q01454 FUN14YAL008W 597 nt12.26□□□□□ -0.45
CTF4Q01454 YNR029CYNR029C 1290 nt12.24□□□□□ -0.45
CTF4Q01454 ADH7YCR105W 1086 nt12.22□□□□□ -0.45
CTF4Q01454 LOT5YKL183W 921 nt12.22□□□□□ -0.45
CTF4Q01454 YPI1YFR003C 468 nt12.21□□□□□ -0.45
CTF4Q01454 ADH1YOL086C 1047 nt12.21□□□□□ -0.45
CTF4Q01454 PAU15YIR041W 375 nt12.2□□□□□ -0.46
CTF4Q01454 YGR259CYGR259C 441 nt12.19□□□□□ -0.46
CTF4Q01454 YAR028WYAR028W 705 nt12.19□□□□□ -0.46
CTF4Q01454 YLR349WYLR349W 507 nt12.19□□□□□ -0.46
CTF4Q01454 ALP1YNL270C 1722 nt12.19□□□□□ -0.46
CTF4Q01454 RPM1RPM1 483 nt12.18□□□□□ -0.46
CTF4Q01454 GND1YHR183W 1470 nt12.18□□□□□ -0.46
CTF4Q01454 AKR2YOR034C 2250 nt12.18□□□□□ -0.46
CTF4Q01454 DIF1YLR437C 402 nt12.17□□□□□ -0.46
CTF4Q01454 AAC1YMR056C 930 nt12.17□□□□□ -0.46
CTF4Q01454 YKR005CYKR005C 1578 nt12.16□□□□□ -0.46
CTF4Q01454 ZTA1YBR046C 1005 nt12.15□□□□□ -0.46
CTF4Q01454 UTR1YJR049C 1593 nt12.14□□□□□ -0.47
CTF4Q01454 GPN2YOR262W 1044 nt12.14□□□□□ -0.47
CTF4Q01454 APT2YDR441C 546 nt12.13□□□□□ -0.47
CTF4Q01454 MTG2YHR168W 1557 nt12.11□□□□□ -0.47
CTF4Q01454 SMM1YNR015W 1155 nt12.1□□□□□ -0.47
CTF4Q01454 SAM35YHR083W 990 nt12.08□□□□□ -0.48
CTF4Q01454 PRP4YPR178W 1398 nt12.07□□□□□ -0.48
CTF4Q01454 YEL008WYEL008W 381 nt12.06□□□□□ -0.48
CTF4Q01454 BMT6YLR063W 1098 nt12.06□□□□□ -0.48
CTF4Q01454 LSB3YFR024C-A 1380 nt12.03□□□□□ -0.48
CTF4Q01454 CPD1YGR247W 720 nt12.01□□□□□ -0.49
CTF4Q01454 HSP60YLR259C 1719 nt12□□□□□ -0.49
CTF4Q01454 RIB2YOL066C 1776 nt11.99□□□□□ -0.49
CTF4Q01454 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.98□□□□□ -0.49
CTF4Q01454 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.98□□□□□ -0.49
CTF4Q01454 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.98□□□□□ -0.49
CTF4Q01454 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.98□□□□□ -0.49
CTF4Q01454 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.98□□□□□ -0.49
CTF4Q01454 SED1YDR077W 1017 nt11.97□□□□□ -0.49
CTF4Q01454 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt11.97□□□□□ -0.49
CTF4Q01454 PRM5YIL117C 957 nt11.97□□□□□ -0.49
CTF4Q01454 DPS1YLL018C 1674 nt11.97□□□□□ -0.49
CTF4Q01454 FCY21YER060W 1587 nt11.96□□□□□ -0.49
CTF4Q01454 VRG4YGL225W 1014 nt11.93□□□□□ -0.5
CTF4Q01454 LIP1YMR298W 453 nt11.93□□□□□ -0.5
CTF4Q01454 PRY1YJL079C 900 nt11.92□□□□□ -0.5
CTF4Q01454 YJL225CYJL225C 5277 nt11.92□□□□□ -0.5
CTF4Q01454 UGA4YDL210W 1716 nt11.9□□□□□ -0.5
CTF4Q01454 IRC24YIR036C 792 nt11.87□□□□□ -0.51
CTF4Q01454 ESS1YJR017C 513 nt11.87□□□□□ -0.51
CTF4Q01454 YJL055WYJL055W 738 nt11.84□□□□□ -0.51
CTF4Q01454 MEP3YPR138C 1470 nt11.82□□□□□ -0.52
CTF4Q01454 HXT12YIL170W 1374 nt11.81□□□□□ -0.52
CTF4Q01454 HXT1YHR094C 1713 nt11.81□□□□□ -0.52
CTF4Q01454 TOA2YKL058W 369 nt11.81□□□□□ -0.52
CTF4Q01454 BOR1YNL275W 1731 nt11.8□□□□□ -0.52
CTF4Q01454 ALD4YOR374W 1560 nt11.79□□□□□ -0.52
CTF4Q01454 YMR103CYMR103C 363 nt11.79□□□□□ -0.52
CTF4Q01454 BRR1YPR057W 1026 nt11.79□□□□□ -0.52
CTF4Q01454 YPL251WYPL251W 303 nt11.78□□□□□ -0.52
CTF4Q01454 DBP1YPL119C 1854 nt11.74□□□□□ -0.53
CTF4Q01454 LSB5YCL034W 1065 nt11.74□□□□□ -0.53
CTF4Q01454 YBL086CYBL086C 1401 nt11.74□□□□□ -0.53
CTF4Q01454 PAU5YFL020C 369 nt11.72□□□□□ -0.53
CTF4Q01454 SEN2YLR105C 1134 nt11.72□□□□□ -0.53
CTF4Q01454 GND2YGR256W 1479 nt11.7□□□□□ -0.54
CTF4Q01454 CSM1YCR086W 573 nt11.69□□□□□ -0.54
CTF4Q01454 NUC1YJL208C 990 nt11.69□□□□□ -0.54
CTF4Q01454 LEU9YOR108W 1815 nt11.69□□□□□ -0.54
CTF4Q01454 HIF1YLL022C 1158 nt11.68□□□□□ -0.54
CTF4Q01454 SNF1YDR477W 1902 nt11.68□□□□□ -0.54
CTF4Q01454 SSN3YPL042C 1668 nt11.67□□□□□ -0.54
CTF4Q01454 CCT5YJR064W 1689 nt11.66□□□□□ -0.54
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