Protein–RNA interactions for Protein: P47024

TY4B-J, Transposon Ty4-J Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY4B-JP47024 PEX2YJL210W 816 nt13.11□□□□□ -0.31
TY4B-JP47024 FUN14YAL008W 597 nt13.11□□□□□ -0.31
TY4B-JP47024 TIR3YIL011W 810 nt13.09□□□□□ -0.31
TY4B-JP47024 TOM6YOR045W 186 nt13.09□□□□□ -0.31
TY4B-JP47024 UTH1YKR042W 1098 nt13.08□□□□□ -0.32
TY4B-JP47024 CLB6YGR109C 1143 nt13.05□□□□□ -0.32
TY4B-JP47024 ADH1YOL086C 1047 nt13.05□□□□□ -0.32
TY4B-JP47024 RAX1YOR301W 1308 nt13.04□□□□□ -0.32
TY4B-JP47024 AQY2YLL052C 450 nt13.03□□□□□ -0.32
TY4B-JP47024 HIP1YGR191W 1812 nt13.02□□□□□ -0.33
TY4B-JP47024 NBP35YGL091C 987 nt12.99□□□□□ -0.33
TY4B-JP47024 SWE1YJL187C 2460 nt12.99□□□□□ -0.33
TY4B-JP47024 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.98□□□□□ -0.33
TY4B-JP47024 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.98□□□□□ -0.33
TY4B-JP47024 ZTA1YBR046C 1005 nt12.97□□□□□ -0.33
TY4B-JP47024 LOT5YKL183W 921 nt12.96□□□□□ -0.33
TY4B-JP47024 TIF6YPR016C 738 nt12.96□□□□□ -0.33
TY4B-JP47024 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt12.95□□□□□ -0.34
TY4B-JP47024 GPN2YOR262W 1044 nt12.93□□□□□ -0.34
TY4B-JP47024 ATG15YCR068W 1563 nt12.91□□□□□ -0.34
TY4B-JP47024 AAC1YMR056C 930 nt12.9□□□□□ -0.34
TY4B-JP47024 YJL195CYJL195C 702 nt12.9□□□□□ -0.34
TY4B-JP47024 POM34YLR018C 900 nt12.89□□□□□ -0.35
TY4B-JP47024 RIB3YDR487C 627 nt12.86□□□□□ -0.35
TY4B-JP47024 CPD1YGR247W 720 nt12.83□□□□□ -0.35
TY4B-JP47024 YPI1YFR003C 468 nt12.82□□□□□ -0.36
TY4B-JP47024 AKR2YOR034C 2250 nt12.81□□□□□ -0.36
TY4B-JP47024 DUS1YML080W 1272 nt12.81□□□□□ -0.36
TY4B-JP47024 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt12.81□□□□□ -0.36
TY4B-JP47024 PRO1YDR300C 1287 nt12.8□□□□□ -0.36
TY4B-JP47024 ESS1YJR017C 513 nt12.78□□□□□ -0.36
TY4B-JP47024 SEN2YLR105C 1134 nt12.78□□□□□ -0.36
TY4B-JP47024 GND1YHR183W 1470 nt12.77□□□□□ -0.36
TY4B-JP47024 YML089CYML089C 369 nt12.77□□□□□ -0.37
TY4B-JP47024 MET28YIR017C 564 nt12.76□□□□□ -0.37
TY4B-JP47024 YEL008WYEL008W 381 nt12.76□□□□□ -0.37
TY4B-JP47024 LSC2YGR244C 1284 nt12.75□□□□□ -0.37
TY4B-JP47024 PUP1YOR157C 786 nt12.74□□□□□ -0.37
TY4B-JP47024 STR3YGL184C 1398 nt12.72□□□□□ -0.37
TY4B-JP47024 YCL074WYCL074W 927 nt12.72□□□□□ -0.37
TY4B-JP47024 DIF1YLR437C 402 nt12.71□□□□□ -0.38
TY4B-JP47024 FIT3YOR383C 615 nt12.71□□□□□ -0.38
TY4B-JP47024 RIB2YOL066C 1776 nt12.7□□□□□ -0.38
TY4B-JP47024 APT2YDR441C 546 nt12.7□□□□□ -0.38
TY4B-JP47024 UGA4YDL210W 1716 nt12.68□□□□□ -0.38
TY4B-JP47024 LSB3YFR024C-A 1380 nt12.66□□□□□ -0.38
TY4B-JP47024 ARP6YLR085C 1317 nt12.65□□□□□ -0.38
TY4B-JP47024 RTN2YDL204W 1182 nt12.64□□□□□ -0.39
TY4B-JP47024 YJL055WYJL055W 738 nt12.61□□□□□ -0.39
TY4B-JP47024 GAP1YKR039W 1809 nt12.61□□□□□ -0.39
TY4B-JP47024 PRY1YJL079C 900 nt12.6□□□□□ -0.39
TY4B-JP47024 YAR028WYAR028W 705 nt12.6□□□□□ -0.39
TY4B-JP47024 SMM1YNR015W 1155 nt12.6□□□□□ -0.39
TY4B-JP47024 ALD4YOR374W 1560 nt12.6□□□□□ -0.39
TY4B-JP47024 PGC1YPL206C 966 nt12.58□□□□□ -0.4
TY4B-JP47024 PLB1YMR008C 1995 nt12.56□□□□□ -0.4
TY4B-JP47024 NAP1YKR048C 1254 nt12.53□□□□□ -0.4
TY4B-JP47024 FCY21YER060W 1587 nt12.53□□□□□ -0.4
TY4B-JP47024 PAU5YFL020C 369 nt12.53□□□□□ -0.4
TY4B-JP47024 HXT12YIL170W 1374 nt12.51□□□□□ -0.41
TY4B-JP47024 UTR1YJR049C 1593 nt12.5□□□□□ -0.41
TY4B-JP47024 MTG2YHR168W 1557 nt12.48□□□□□ -0.41
TY4B-JP47024 YBR232CYBR232C 360 nt12.46□□□□□ -0.41
TY4B-JP47024 YJL064WYJL064W 396 nt12.42□□□□□ -0.42
TY4B-JP47024 FUR4YBR021W 1902 nt12.42□□□□□ -0.42
TY4B-JP47024 ALP1YNL270C 1722 nt12.41□□□□□ -0.42
TY4B-JP47024 MEP3YPR138C 1470 nt12.41□□□□□ -0.42
TY4B-JP47024 YJL118WYJL118W 660 nt12.41□□□□□ -0.42
TY4B-JP47024 THI72YOR192C 1800 nt12.4□□□□□ -0.42
TY4B-JP47024 PAU19YMR325W 375 nt12.4□□□□□ -0.42
TY4B-JP47024 PRM5YIL117C 957 nt12.39□□□□□ -0.43
TY4B-JP47024 SLG1YOR008C 1137 nt12.39□□□□□ -0.43
TY4B-JP47024 TIP1YBR067C 633 nt12.39□□□□□ -0.43
TY4B-JP47024 CCT5YJR064W 1689 nt12.38□□□□□ -0.43
TY4B-JP47024 VRG4YGL225W 1014 nt12.38□□□□□ -0.43
TY4B-JP47024 HSP60YLR259C 1719 nt12.38□□□□□ -0.43
TY4B-JP47024 YJR114WYJR114W 393 nt12.37□□□□□ -0.43
TY4B-JP47024 SED1YDR077W 1017 nt12.37□□□□□ -0.43
TY4B-JP47024 YKR005CYKR005C 1578 nt12.3□□□□□ -0.44
TY4B-JP47024 YER190C-AYER190C-A 576 nt12.28□□□□□ -0.44
TY4B-JP47024 YGR259CYGR259C 441 nt12.28□□□□□ -0.44
TY4B-JP47024 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt12.28□□□□□ -0.44
TY4B-JP47024 YML133W-AYML133W-A 576 nt12.28□□□□□ -0.44
TY4B-JP47024 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt12.28□□□□□ -0.44
TY4B-JP47024 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt12.28□□□□□ -0.44
TY4B-JP47024 YPL251WYPL251W 303 nt12.25□□□□□ -0.45
TY4B-JP47024 SNZ1YMR096W 894 nt12.23□□□□□ -0.45
TY4B-JP47024 LSB5YCL034W 1065 nt12.23□□□□□ -0.45
TY4B-JP47024 GAL3YDR009W 1563 nt12.21□□□□□ -0.45
TY4B-JP47024 YBL086CYBL086C 1401 nt12.19□□□□□ -0.46
TY4B-JP47024 TIM44YIL022W 1296 nt12.18□□□□□ -0.46
TY4B-JP47024 LIP1YMR298W 453 nt12.16□□□□□ -0.46
TY4B-JP47024 STP3YLR375W 1032 nt12.15□□□□□ -0.46
TY4B-JP47024 CSM1YCR086W 573 nt12.14□□□□□ -0.47
TY4B-JP47024 SAM3YPL274W 1764 nt12.14□□□□□ -0.47
TY4B-JP47024 SAM35YHR083W 990 nt12.14□□□□□ -0.47
TY4B-JP47024 ERG6YML008C 1152 nt12.11□□□□□ -0.47
TY4B-JP47024 NUC1YJL208C 990 nt12.11□□□□□ -0.47
TY4B-JP47024 CDD1YLR245C 429 nt12.1□□□□□ -0.47
TY4B-JP47024 APS2YJR058C 444 nt12.09□□□□□ -0.47
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