Protein–RNA interactions for Protein: P38871

SSP1, Sporulation-specific protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP1P38871 SEC11YIR022W 504 nt12.47□□□□□ -0.41
SSP1P38871 RSA3YLR221C 663 nt12.47□□□□□ -0.41
SSP1P38871 SLX1YBR228W 915 nt12.47□□□□□ -0.41
SSP1P38871 DLD2YDL178W 1593 nt12.47□□□□□ -0.41
SSP1P38871 PCH2YBR186W 1695 nt12.45□□□□□ -0.42
SSP1P38871 YGR011WYGR011W 327 nt12.42□□□□□ -0.42
SSP1P38871 YLR460CYLR460C 1131 nt12.41□□□□□ -0.42
SSP1P38871 RAI1YGL246C 1164 nt12.4□□□□□ -0.42
SSP1P38871 snR34snR34 203 nt12.4□□□□□ -0.42
SSP1P38871 GUT2YIL155C 1950 nt12.39□□□□□ -0.43
SSP1P38871 YSC84YHR016C 1407 nt12.39□□□□□ -0.43
SSP1P38871 LIP2YLR239C 987 nt12.39□□□□□ -0.43
SSP1P38871 YOL107WYOL107W 1029 nt12.37□□□□□ -0.43
SSP1P38871 RNQ1YCL028W 1218 nt12.37□□□□□ -0.43
SSP1P38871 YMR210WYMR210W 1350 nt12.36□□□□□ -0.43
SSP1P38871 YHL050CYHL050C 2094 nt12.35□□□□□ -0.43
SSP1P38871 ERV46YAL042W 1248 nt12.35□□□□□ -0.43
SSP1P38871 NUP57YGR119C 1626 nt12.34□□□□□ -0.43
SSP1P38871 YDR433WYDR433W 441 nt12.34□□□□□ -0.43
SSP1P38871 LPX1YOR084W 1164 nt12.34□□□□□ -0.43
SSP1P38871 PRM4YPL156C 855 nt12.34□□□□□ -0.43
SSP1P38871 GBP2YCL011C 1284 nt12.34□□□□□ -0.43
SSP1P38871 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.34□□□□□ -0.43
SSP1P38871 YNL319WYNL319W 441 nt12.33□□□□□ -0.44
SSP1P38871 YCR049CYCR049C 447 nt12.32□□□□□ -0.44
SSP1P38871 IDP3YNL009W 1263 nt12.32□□□□□ -0.44
SSP1P38871 MSA2YKR077W 1092 nt12.31□□□□□ -0.44
SSP1P38871 RRT12YCR045C 1476 nt12.3□□□□□ -0.44
SSP1P38871 ATG22YCL038C 1587 nt12.3□□□□□ -0.44
SSP1P38871 PAC11YDR488C 1602 nt12.29□□□□□ -0.44
SSP1P38871 YIL100WYIL100W 354 nt12.29□□□□□ -0.44
SSP1P38871 SUT2YPR009W 807 nt12.29□□□□□ -0.44
SSP1P38871 NMD4YLR363C 657 nt12.27□□□□□ -0.45
SSP1P38871 CSI1YMR025W 888 nt12.27□□□□□ -0.45
SSP1P38871 YNL303WYNL303W 348 nt12.27□□□□□ -0.45
SSP1P38871 snR189snR189 189 nt12.27□□□□□ -0.45
SSP1P38871 PEX22YAL055W 543 nt12.26□□□□□ -0.45
SSP1P38871 YKR040CYKR040C 504 nt12.25□□□□□ -0.45
SSP1P38871 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt12.25□□□□□ -0.45
SSP1P38871 YIL092WYIL092W 1902 nt12.25□□□□□ -0.45
SSP1P38871 ECM9YKR004C 1134 nt12.24□□□□□ -0.45
SSP1P38871 OSW1YOR255W 837 nt12.24□□□□□ -0.45
SSP1P38871 PIB2YGL023C 1908 nt12.23□□□□□ -0.45
SSP1P38871 PTC7YHR076W 1032 nt12.23□□□□□ -0.45
SSP1P38871 YNL195CYNL195C 786 nt12.23□□□□□ -0.45
SSP1P38871 NPL6YMR091C 1308 nt12.2□□□□□ -0.46
SSP1P38871 YGR283CYGR283C 1026 nt12.2□□□□□ -0.46
SSP1P38871 YLR169WYLR169W 354 nt12.2□□□□□ -0.46
SSP1P38871 TCD2YKL027W 1344 nt12.19□□□□□ -0.46
SSP1P38871 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt12.18□□□□□ -0.46
SSP1P38871 VAM3YOR106W 852 nt12.18□□□□□ -0.46
SSP1P38871 MXR2YCL033C 507 nt12.18□□□□□ -0.46
SSP1P38871 COS6YGR295C 1146 nt12.15□□□□□ -0.46
SSP1P38871 REX3YLR107W 1215 nt12.15□□□□□ -0.46
SSP1P38871 SPC24YMR117C 642 nt12.15□□□□□ -0.46
SSP1P38871 MRPL8YJL063C 717 nt12.14□□□□□ -0.47
SSP1P38871 DBR1YKL149C 1218 nt12.14□□□□□ -0.47
SSP1P38871 DSC2YOL073C 969 nt12.14□□□□□ -0.47
SSP1P38871 SPP1YPL138C 1062 nt12.14□□□□□ -0.47
SSP1P38871 FES1YBR101C 873 nt12.14□□□□□ -0.47
SSP1P38871 RER1YCL001W 567 nt12.14□□□□□ -0.47
SSP1P38871 RTF1YGL244W 1677 nt12.13□□□□□ -0.47
SSP1P38871 ISA2YPR067W 558 nt12.13□□□□□ -0.47
SSP1P38871 ZTA1YBR046C 1005 nt12.12□□□□□ -0.47
SSP1P38871 LSB5YCL034W 1065 nt12.12□□□□□ -0.47
SSP1P38871 ISR1YPR106W 1332 nt12.11□□□□□ -0.47
SSP1P38871 RTG3YBL103C 1461 nt12.11□□□□□ -0.47
SSP1P38871 HAT2YEL056W 1206 nt12.11□□□□□ -0.47
SSP1P38871 ELO1YJL196C 933 nt12.11□□□□□ -0.47
SSP1P38871 MHO1YJR008W 1017 nt12.1□□□□□ -0.47
SSP1P38871 RSF1YMR030W 1131 nt12.1□□□□□ -0.47
SSP1P38871 MRPL24YMR193W 777 nt12.1□□□□□ -0.47
SSP1P38871 YHR022CYHR022C 771 nt12.08□□□□□ -0.48
SSP1P38871 YHR145CYHR145C 357 nt12.07□□□□□ -0.48
SSP1P38871 JJJ3YJR097W 519 nt12.07□□□□□ -0.48
SSP1P38871 BOP3YNL042W 1191 nt12.07□□□□□ -0.48
SSP1P38871 ARC35YNR035C 1029 nt12.07□□□□□ -0.48
SSP1P38871 ARR1YPR199C 885 nt12.07□□□□□ -0.48
SSP1P38871 BUD16YEL029C 939 nt12.06□□□□□ -0.48
SSP1P38871 OMA1YKR087C 1038 nt12.06□□□□□ -0.48
SSP1P38871 ERG29YMR134W 714 nt12.06□□□□□ -0.48
SSP1P38871 RRP40YOL142W 723 nt12.06□□□□□ -0.48
SSP1P38871 RRD1YIL153W 1182 nt12.05□□□□□ -0.48
SSP1P38871 DED1YOR204W 1815 nt12.04□□□□□ -0.48
SSP1P38871 MAD2YJL030W 591 nt12.04□□□□□ -0.48
SSP1P38871 YLR198CYLR198C 360 nt12.04□□□□□ -0.48
SSP1P38871 SPR1YOR190W 1338 nt12.04□□□□□ -0.48
SSP1P38871 YKR104WYKR104W 921 nt12.03□□□□□ -0.48
SSP1P38871 MAS1YLR163C 1389 nt12.03□□□□□ -0.48
SSP1P38871 ADO1YJR105W 1023 nt12.02□□□□□ -0.49
SSP1P38871 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt12.01□□□□□ -0.49
SSP1P38871 FSH1YHR049W 732 nt12.01□□□□□ -0.49
SSP1P38871 NUR1YDL089W 1455 nt12.01□□□□□ -0.49
SSP1P38871 NCP1YHR042W 2076 nt12.01□□□□□ -0.49
SSP1P38871 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12□□□□□ -0.49
SSP1P38871 YEL076CYEL076C 651 nt12□□□□□ -0.49
SSP1P38871 YLR464WYLR464W 651 nt12□□□□□ -0.49
SSP1P38871 TRP4YDR354W 1143 nt11.99□□□□□ -0.49
SSP1P38871 POS5YPL188W 1245 nt11.99□□□□□ -0.49
SSP1P38871 NUF2YOL069W 1356 nt11.99□□□□□ -0.49
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