Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 RFC1YOR217W 2586 nt9.46□□□□□ -0.89
SSZ1P38788 TIM17YJL143W 477 nt9.46□□□□□ -0.9
SSZ1P38788 YCR102CYCR102C 1107 nt9.45□□□□□ -0.9
SSZ1P38788 NIT1YIL164C 600 nt9.45□□□□□ -0.9
SSZ1P38788 MUP1YGR055W 1725 nt9.45□□□□□ -0.9
SSZ1P38788 ZRT3YKL175W 1512 nt9.41□□□□□ -0.9
SSZ1P38788 GAL2YLR081W 1725 nt9.4□□□□□ -0.9
SSZ1P38788 THI72YOR192C 1800 nt9.4□□□□□ -0.91
SSZ1P38788 BSP1YPR171W 1731 nt9.39□□□□□ -0.91
SSZ1P38788 UTR1YJR049C 1593 nt9.38□□□□□ -0.91
SSZ1P38788 YSP3YOR003W 1437 nt9.37□□□□□ -0.91
SSZ1P38788 UBX6YJL048C 1191 nt9.36□□□□□ -0.91
SSZ1P38788 HOL1YNR055C 1761 nt9.36□□□□□ -0.91
SSZ1P38788 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.34□□□□□ -0.91
SSZ1P38788 LSC2YGR244C 1284 nt9.34□□□□□ -0.91
SSZ1P38788 SAM35YHR083W 990 nt9.34□□□□□ -0.91
SSZ1P38788 SGT2YOR007C 1041 nt9.34□□□□□ -0.91
SSZ1P38788 TOK1YJL093C 2076 nt9.33□□□□□ -0.92
SSZ1P38788 YGR139WYGR139W 339 nt9.32□□□□□ -0.92
SSZ1P38788 GAP1YKR039W 1809 nt9.31□□□□□ -0.92
SSZ1P38788 TIR3YIL011W 810 nt9.29□□□□□ -0.92
SSZ1P38788 YJL067WYJL067W 351 nt9.28□□□□□ -0.92
SSZ1P38788 MET8YBR213W 825 nt9.26□□□□□ -0.93
SSZ1P38788 RTG1YOL067C 534 nt9.25□□□□□ -0.93
SSZ1P38788 YHL008CYHL008C 1884 nt9.25□□□□□ -0.93
SSZ1P38788 ILV3YJR016C 1758 nt9.21□□□□□ -0.94
SSZ1P38788 DBP1YPL119C 1854 nt9.21□□□□□ -0.94
SSZ1P38788 PRO1YDR300C 1287 nt9.2□□□□□ -0.94
SSZ1P38788 CLB6YGR109C 1143 nt9.2□□□□□ -0.94
SSZ1P38788 YNL115CYNL115C 1935 nt9.19□□□□□ -0.94
SSZ1P38788 HXK1YFR053C 1458 nt9.19□□□□□ -0.94
SSZ1P38788 POM34YLR018C 900 nt9.18□□□□□ -0.94
SSZ1P38788 SHH4YLR164W 507 nt9.18□□□□□ -0.94
SSZ1P38788 NRT1YOR071C 1797 nt9.17□□□□□ -0.94
SSZ1P38788 VPS75YNL246W 795 nt9.17□□□□□ -0.94
SSZ1P38788 HXT1YHR094C 1713 nt9.16□□□□□ -0.94
SSZ1P38788 DIF1YLR437C 402 nt9.15□□□□□ -0.94
SSZ1P38788 YNL024CYNL024C 741 nt9.15□□□□□ -0.94
SSZ1P38788 YML089CYML089C 369 nt9.14□□□□□ -0.95
SSZ1P38788 PEX25YPL112C 1185 nt9.14□□□□□ -0.95
SSZ1P38788 YMR209CYMR209C 1374 nt9.13□□□□□ -0.95
SSZ1P38788 SHY1YGR112W 1170 nt9.13□□□□□ -0.95
SSZ1P38788 YOR325WYOR325W 474 nt9.13□□□□□ -0.95
SSZ1P38788 ATG15YCR068W 1563 nt9.12□□□□□ -0.95
SSZ1P38788 ALD5YER073W 1563 nt9.12□□□□□ -0.95
SSZ1P38788 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.1□□□□□ -0.95
SSZ1P38788 Q0010Q0010 387 nt9.1□□□□□ -0.95
SSZ1P38788 HUA1YGR268C 597 nt9.08□□□□□ -0.96
SSZ1P38788 UGP1YKL035W 1500 nt9.07□□□□□ -0.96
SSZ1P38788 HEM14YER014W 1620 nt9.07□□□□□ -0.96
SSZ1P38788 YJR154WYJR154W 1041 nt9.07□□□□□ -0.96
SSZ1P38788 OPI10YOL032W 741 nt9.07□□□□□ -0.96
SSZ1P38788 COQ8YGL119W 1506 nt9.05□□□□□ -0.96
SSZ1P38788 HIS2YFR025C 1008 nt9.05□□□□□ -0.96
SSZ1P38788 RET2YFR051C 1641 nt9.05□□□□□ -0.96
SSZ1P38788 MTO1YGL236C 2010 nt9.04□□□□□ -0.96
SSZ1P38788 URA6YKL024C 615 nt9.04□□□□□ -0.96
SSZ1P38788 YBL086CYBL086C 1401 nt9.04□□□□□ -0.96
SSZ1P38788 PAU7YAR020C 168 nt9.03□□□□□ -0.96
SSZ1P38788 PRE6YOL038W 765 nt9.03□□□□□ -0.96
SSZ1P38788 SFA1YDL168W 1161 nt9□□□□□ -0.97
SSZ1P38788 LIP1YMR298W 453 nt9□□□□□ -0.97
SSZ1P38788 ARO8YGL202W 1503 nt9□□□□□ -0.97
SSZ1P38788 YFL066CYFL066C 1179 nt8.99□□□□□ -0.97
SSZ1P38788 TOM6YOR045W 186 nt8.99□□□□□ -0.97
SSZ1P38788 CCT2YIL142W 1584 nt8.99□□□□□ -0.97
SSZ1P38788 YDR010CYDR010C 333 nt8.98□□□□□ -0.97
SSZ1P38788 CWC15YDR163W 528 nt8.98□□□□□ -0.97
SSZ1P38788 MRP20YDR405W 792 nt8.98□□□□□ -0.97
SSZ1P38788 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.98□□□□□ -0.97
SSZ1P38788 UFO1YML088W 2007 nt8.97□□□□□ -0.97
SSZ1P38788 SED1YDR077W 1017 nt8.97□□□□□ -0.97
SSZ1P38788 TIF6YPR016C 738 nt8.97□□□□□ -0.97
SSZ1P38788 YAR028WYAR028W 705 nt8.96□□□□□ -0.98
SSZ1P38788 MEP3YPR138C 1470 nt8.96□□□□□ -0.98
SSZ1P38788 LEU9YOR108W 1815 nt8.95□□□□□ -0.98
SSZ1P38788 SGA1YIL099W 1650 nt8.94□□□□□ -0.98
SSZ1P38788 KES1YPL145C 1305 nt8.94□□□□□ -0.98
SSZ1P38788 PSD1YNL169C 1503 nt8.94□□□□□ -0.98
SSZ1P38788 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.93□□□□□ -0.98
SSZ1P38788 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.93□□□□□ -0.98
SSZ1P38788 CSM2YIL132C 642 nt8.93□□□□□ -0.98
SSZ1P38788 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.93□□□□□ -0.98
SSZ1P38788 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.93□□□□□ -0.98
SSZ1P38788 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.93□□□□□ -0.98
SSZ1P38788 LSB6YJL100W 1824 nt8.92□□□□□ -0.98
SSZ1P38788 FRA1YLL029W 2250 nt8.92□□□□□ -0.98
SSZ1P38788 SHB17YKR043C 816 nt8.91□□□□□ -0.98
SSZ1P38788 ZAP1YJL056C 2643 nt8.9□□□□□ -0.98
SSZ1P38788 SAM1YLR180W 1149 nt8.9□□□□□ -0.98
SSZ1P38788 PET8YNL003C 855 nt8.9□□□□□ -0.98
SSZ1P38788 TPN1YGL186C 1740 nt8.9□□□□□ -0.98
SSZ1P38788 MTG2YHR168W 1557 nt8.9□□□□□ -0.99
SSZ1P38788 HIP1YGR191W 1812 nt8.89□□□□□ -0.99
SSZ1P38788 OYE3YPL171C 1203 nt8.89□□□□□ -0.99
SSZ1P38788 BET2YPR176C 978 nt8.89□□□□□ -0.99
SSZ1P38788 TOM71YHR117W 1920 nt8.88□□□□□ -0.99
SSZ1P38788 YFR018CYFR018C 1092 nt8.88□□□□□ -0.99
SSZ1P38788 PEX2YJL210W 816 nt8.88□□□□□ -0.99
SSZ1P38788 YRF1-2YER190W 5046 nt8.88□□□□□ -0.99
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