Protein–RNA interactions for Protein: P34162

SRB2, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, yeastyeast

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRB2P34162 LSC2YGR244C 1284 nt10.41□□□□□ -0.74
SRB2P34162 POM34YLR018C 900 nt10.41□□□□□ -0.74
SRB2P34162 NDI1YML120C 1542 nt10.4□□□□□ -0.74
SRB2P34162 PRO1YDR300C 1287 nt10.38□□□□□ -0.75
SRB2P34162 TOM6YOR045W 186 nt10.38□□□□□ -0.75
SRB2P34162 DPS1YLL018C 1674 nt10.37□□□□□ -0.75
SRB2P34162 YML089CYML089C 369 nt10.35□□□□□ -0.75
SRB2P34162 PLB1YMR008C 1995 nt10.34□□□□□ -0.75
SRB2P34162 BMT6YLR063W 1098 nt10.34□□□□□ -0.75
SRB2P34162 RPL4BYDR012W 1089 nt10.33□□□□□ -0.76
SRB2P34162 RPL4AYBR031W 1089 nt10.33□□□□□ -0.76
SRB2P34162 GLR1YPL091W 1452 nt10.33□□□□□ -0.76
SRB2P34162 MCH5YOR306C 1566 nt10.33□□□□□ -0.76
SRB2P34162 ATG15YCR068W 1563 nt10.32□□□□□ -0.76
SRB2P34162 PEX2YJL210W 816 nt10.32□□□□□ -0.76
SRB2P34162 YMR244WYMR244W 1068 nt10.32□□□□□ -0.76
SRB2P34162 AAC1YMR056C 930 nt10.31□□□□□ -0.76
SRB2P34162 HIP1YGR191W 1812 nt10.3□□□□□ -0.76
SRB2P34162 GAP1YKR039W 1809 nt10.3□□□□□ -0.76
SRB2P34162 CLB6YGR109C 1143 nt10.28□□□□□ -0.76
SRB2P34162 RPS14BYJL191W 417 nt10.27□□□□□ -0.77
SRB2P34162 UTH1YKR042W 1098 nt10.27□□□□□ -0.77
SRB2P34162 RPM1RPM1 483 nt10.27□□□□□ -0.77
SRB2P34162 TIF6YPR016C 738 nt10.27□□□□□ -0.77
SRB2P34162 IRC24YIR036C 792 nt10.24□□□□□ -0.77
SRB2P34162 NRT1YOR071C 1797 nt10.22□□□□□ -0.77
SRB2P34162 MET28YIR017C 564 nt10.22□□□□□ -0.77
SRB2P34162 SNF1YDR477W 1902 nt10.2□□□□□ -0.78
SRB2P34162 UTR1YJR049C 1593 nt10.2□□□□□ -0.78
SRB2P34162 NAR1YNL240C 1476 nt10.17□□□□□ -0.78
SRB2P34162 DIF1YLR437C 402 nt10.16□□□□□ -0.78
SRB2P34162 SDH5YOL071W 489 nt10.16□□□□□ -0.78
SRB2P34162 RBG2YGR173W 1107 nt10.14□□□□□ -0.79
SRB2P34162 PRM5YIL117C 957 nt10.14□□□□□ -0.79
SRB2P34162 TSC10YBR265W 963 nt10.14□□□□□ -0.79
SRB2P34162 BIO5YNR056C 1686 nt10.12□□□□□ -0.79
SRB2P34162 YMR226CYMR226C 804 nt10.12□□□□□ -0.79
SRB2P34162 FIT3YOR383C 615 nt10.11□□□□□ -0.79
SRB2P34162 YLR111WYLR111W 333 nt10.1□□□□□ -0.79
SRB2P34162 YGR012WYGR012W 1182 nt10.09□□□□□ -0.79
SRB2P34162 YAR028WYAR028W 705 nt10.09□□□□□ -0.79
SRB2P34162 YLR279WYLR279W 390 nt10.08□□□□□ -0.8
SRB2P34162 RAD23YEL037C 1197 nt10.07□□□□□ -0.8
SRB2P34162 SAM35YHR083W 990 nt10.07□□□□□ -0.8
SRB2P34162 MTG2YHR168W 1557 nt10.04□□□□□ -0.8
SRB2P34162 ZTA1YBR046C 1005 nt10.03□□□□□ -0.8
SRB2P34162 CAB5YDR196C 726 nt10.02□□□□□ -0.81
SRB2P34162 MSB4YOL112W 1479 nt10.02□□□□□ -0.81
SRB2P34162 ALP1YNL270C 1722 nt10.02□□□□□ -0.81
SRB2P34162 AKR2YOR034C 2250 nt10.02□□□□□ -0.81
SRB2P34162 ALD4YOR374W 1560 nt10.01□□□□□ -0.81
SRB2P34162 PBP1YGR178C 2169 nt9.99□□□□□ -0.81
SRB2P34162 CYT2YKL087C 675 nt9.99□□□□□ -0.81
SRB2P34162 HIF1YLL022C 1158 nt9.99□□□□□ -0.81
SRB2P34162 RIB3YDR487C 627 nt9.98□□□□□ -0.81
SRB2P34162 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.98□□□□□ -0.81
SRB2P34162 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.96□□□□□ -0.82
SRB2P34162 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.96□□□□□ -0.82
SRB2P34162 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.96□□□□□ -0.82
SRB2P34162 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.96□□□□□ -0.82
SRB2P34162 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.96□□□□□ -0.82
SRB2P34162 SED1YDR077W 1017 nt9.95□□□□□ -0.82
SRB2P34162 DBP1YPL119C 1854 nt9.93□□□□□ -0.82
SRB2P34162 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.92□□□□□ -0.82
SRB2P34162 LIP1YMR298W 453 nt9.91□□□□□ -0.82
SRB2P34162 HXT1YHR094C 1713 nt9.9□□□□□ -0.82
SRB2P34162 YBL086CYBL086C 1401 nt9.88□□□□□ -0.83
SRB2P34162 FRE6YLL051C 2139 nt9.86□□□□□ -0.83
SRB2P34162 SAM1YLR180W 1149 nt9.84□□□□□ -0.83
SRB2P34162 YPL251WYPL251W 303 nt9.84□□□□□ -0.83
SRB2P34162 GND1YHR183W 1470 nt9.84□□□□□ -0.83
SRB2P34162 FCY21YER060W 1587 nt9.83□□□□□ -0.84
SRB2P34162 UGA4YDL210W 1716 nt9.82□□□□□ -0.84
SRB2P34162 LOT5YKL183W 921 nt9.81□□□□□ -0.84
SRB2P34162 LEU9YOR108W 1815 nt9.81□□□□□ -0.84
SRB2P34162 CMP2YML057W 1815 nt9.8□□□□□ -0.84
SRB2P34162 BRR1YPR057W 1026 nt9.8□□□□□ -0.84
SRB2P34162 SHY1YGR112W 1170 nt9.79□□□□□ -0.84
SRB2P34162 SMM1YNR015W 1155 nt9.78□□□□□ -0.84
SRB2P34162 APT2YDR441C 546 nt9.77□□□□□ -0.85
SRB2P34162 TOA2YKL058W 369 nt9.77□□□□□ -0.85
SRB2P34162 MEP3YPR138C 1470 nt9.76□□□□□ -0.85
SRB2P34162 YAT1YAR035W 2064 nt9.76□□□□□ -0.85
SRB2P34162 ZRT3YKL175W 1512 nt9.76□□□□□ -0.85
SRB2P34162 YMR103CYMR103C 363 nt9.75□□□□□ -0.85
SRB2P34162 YPI1YFR003C 468 nt9.74□□□□□ -0.85
SRB2P34162 UFO1YML088W 2007 nt9.73□□□□□ -0.85
SRB2P34162 PRY1YJL079C 900 nt9.73□□□□□ -0.85
SRB2P34162 ADH1YOL086C 1047 nt9.71□□□□□ -0.86
SRB2P34162 GND2YGR256W 1479 nt9.71□□□□□ -0.86
SRB2P34162 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.69□□□□□ -0.86
SRB2P34162 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.69□□□□□ -0.86
SRB2P34162 URA6YKL024C 615 nt9.69□□□□□ -0.86
SRB2P34162 YNR029CYNR029C 1290 nt9.69□□□□□ -0.86
SRB2P34162 YJL067WYJL067W 351 nt9.66□□□□□ -0.86
SRB2P34162 YJL195CYJL195C 702 nt9.65□□□□□ -0.86
SRB2P34162 OYE3YPL171C 1203 nt9.65□□□□□ -0.86
SRB2P34162 SSN3YPL042C 1668 nt9.64□□□□□ -0.87
SRB2P34162 HXT12YIL170W 1374 nt9.64□□□□□ -0.87
SRB2P34162 CSM1YCR086W 573 nt9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms