Protein–RNA interactions for Protein: P29539

RIF1, Telomere length regulator protein RIF1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIF1P29539 BOR1YNL275W 1731 nt10.72□□□□□ -0.69
RIF1P29539 YLR349WYLR349W 507 nt10.71□□□□□ -0.69
RIF1P29539 DUT1YBR252W 444 nt10.71□□□□□ -0.69
RIF1P29539 YLR279WYLR279W 390 nt10.7□□□□□ -0.7
RIF1P29539 MSB4YOL112W 1479 nt10.7□□□□□ -0.7
RIF1P29539 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.7□□□□□ -0.7
RIF1P29539 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.7□□□□□ -0.7
RIF1P29539 RAX1YOR301W 1308 nt10.69□□□□□ -0.7
RIF1P29539 CLB6YGR109C 1143 nt10.69□□□□□ -0.7
RIF1P29539 UTH1YKR042W 1098 nt10.67□□□□□ -0.7
RIF1P29539 TOM6YOR045W 186 nt10.66□□□□□ -0.7
RIF1P29539 YKR005CYKR005C 1578 nt10.65□□□□□ -0.7
RIF1P29539 YCL074WYCL074W 927 nt10.65□□□□□ -0.7
RIF1P29539 PEX2YJL210W 816 nt10.65□□□□□ -0.7
RIF1P29539 NBP35YGL091C 987 nt10.64□□□□□ -0.71
RIF1P29539 RPM1RPM1 483 nt10.63□□□□□ -0.71
RIF1P29539 STE4YOR212W 1272 nt10.62□□□□□ -0.71
RIF1P29539 PAU15YIR041W 375 nt10.62□□□□□ -0.71
RIF1P29539 HIP1YGR191W 1812 nt10.58□□□□□ -0.72
RIF1P29539 YGR259CYGR259C 441 nt10.58□□□□□ -0.72
RIF1P29539 TIF6YPR016C 738 nt10.58□□□□□ -0.72
RIF1P29539 ATG15YCR068W 1563 nt10.57□□□□□ -0.72
RIF1P29539 DUS1YML080W 1272 nt10.56□□□□□ -0.72
RIF1P29539 ZTA1YBR046C 1005 nt10.56□□□□□ -0.72
RIF1P29539 FUN14YAL008W 597 nt10.55□□□□□ -0.72
RIF1P29539 ADH1YOL086C 1047 nt10.54□□□□□ -0.72
RIF1P29539 LOT5YKL183W 921 nt10.51□□□□□ -0.73
RIF1P29539 POM34YLR018C 900 nt10.51□□□□□ -0.73
RIF1P29539 LSC2YGR244C 1284 nt10.5□□□□□ -0.73
RIF1P29539 DPS1YLL018C 1674 nt10.5□□□□□ -0.73
RIF1P29539 AKR2YOR034C 2250 nt10.49□□□□□ -0.73
RIF1P29539 YML089CYML089C 369 nt10.48□□□□□ -0.73
RIF1P29539 RTN2YDL204W 1182 nt10.48□□□□□ -0.73
RIF1P29539 SNF1YDR477W 1902 nt10.47□□□□□ -0.73
RIF1P29539 GND1YHR183W 1470 nt10.47□□□□□ -0.73
RIF1P29539 BMT6YLR063W 1098 nt10.47□□□□□ -0.73
RIF1P29539 STR3YGL184C 1398 nt10.46□□□□□ -0.74
RIF1P29539 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.45□□□□□ -0.74
RIF1P29539 BIO5YNR056C 1686 nt10.44□□□□□ -0.74
RIF1P29539 PRO1YDR300C 1287 nt10.44□□□□□ -0.74
RIF1P29539 MET28YIR017C 564 nt10.44□□□□□ -0.74
RIF1P29539 DIF1YLR437C 402 nt10.44□□□□□ -0.74
RIF1P29539 AAC1YMR056C 930 nt10.43□□□□□ -0.74
RIF1P29539 FIT3YOR383C 615 nt10.43□□□□□ -0.74
RIF1P29539 YPI1YFR003C 468 nt10.41□□□□□ -0.74
RIF1P29539 ARP6YLR085C 1317 nt10.41□□□□□ -0.74
RIF1P29539 RIB3YDR487C 627 nt10.41□□□□□ -0.74
RIF1P29539 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10.41□□□□□ -0.74
RIF1P29539 GAP1YKR039W 1809 nt10.37□□□□□ -0.75
RIF1P29539 YJL195CYJL195C 702 nt10.35□□□□□ -0.75
RIF1P29539 PRM5YIL117C 957 nt10.34□□□□□ -0.75
RIF1P29539 GPN2YOR262W 1044 nt10.34□□□□□ -0.75
RIF1P29539 PLB1YMR008C 1995 nt10.33□□□□□ -0.76
RIF1P29539 UGA4YDL210W 1716 nt10.33□□□□□ -0.76
RIF1P29539 YAR028WYAR028W 705 nt10.33□□□□□ -0.76
RIF1P29539 CPD1YGR247W 720 nt10.32□□□□□ -0.76
RIF1P29539 MCH5YOR306C 1566 nt10.3□□□□□ -0.76
RIF1P29539 NAR1YNL240C 1476 nt10.3□□□□□ -0.76
RIF1P29539 PRP4YPR178W 1398 nt10.3□□□□□ -0.76
RIF1P29539 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.29□□□□□ -0.76
RIF1P29539 UTR1YJR049C 1593 nt10.28□□□□□ -0.76
RIF1P29539 APT2YDR441C 546 nt10.27□□□□□ -0.76
RIF1P29539 RIB2YOL066C 1776 nt10.27□□□□□ -0.77
RIF1P29539 YEL008WYEL008W 381 nt10.25□□□□□ -0.77
RIF1P29539 SEN2YLR105C 1134 nt10.25□□□□□ -0.77
RIF1P29539 PRY1YJL079C 900 nt10.23□□□□□ -0.77
RIF1P29539 SMM1YNR015W 1155 nt10.23□□□□□ -0.77
RIF1P29539 YJL055WYJL055W 738 nt10.23□□□□□ -0.77
RIF1P29539 IRC24YIR036C 792 nt10.22□□□□□ -0.77
RIF1P29539 MEP3YPR138C 1470 nt10.22□□□□□ -0.77
RIF1P29539 UME6YDR207C 2511 nt10.21□□□□□ -0.77
RIF1P29539 FCY21YER060W 1587 nt10.21□□□□□ -0.78
RIF1P29539 ESS1YJR017C 513 nt10.2□□□□□ -0.78
RIF1P29539 ALG12YNR030W 1656 nt10.19□□□□□ -0.78
RIF1P29539 MTG2YHR168W 1557 nt10.19□□□□□ -0.78
RIF1P29539 PBP1YGR178C 2169 nt10.18□□□□□ -0.78
RIF1P29539 ALP1YNL270C 1722 nt10.18□□□□□ -0.78
RIF1P29539 ALD4YOR374W 1560 nt10.18□□□□□ -0.78
RIF1P29539 SED1YDR077W 1017 nt10.17□□□□□ -0.78
RIF1P29539 HXT12YIL170W 1374 nt10.17□□□□□ -0.78
RIF1P29539 YJL118WYJL118W 660 nt10.13□□□□□ -0.79
RIF1P29539 PUP1YOR157C 786 nt10.11□□□□□ -0.79
RIF1P29539 YAT1YAR035W 2064 nt10.1□□□□□ -0.79
RIF1P29539 SAM35YHR083W 990 nt10.09□□□□□ -0.79
RIF1P29539 LSB5YCL034W 1065 nt10.09□□□□□ -0.79
RIF1P29539 VRG4YGL225W 1014 nt10.09□□□□□ -0.79
RIF1P29539 THI72YOR192C 1800 nt10.07□□□□□ -0.8
RIF1P29539 PAU5YFL020C 369 nt10.06□□□□□ -0.8
RIF1P29539 CCT5YJR064W 1689 nt10.04□□□□□ -0.8
RIF1P29539 HIF1YLL022C 1158 nt10.04□□□□□ -0.8
RIF1P29539 NAP1YKR048C 1254 nt10.03□□□□□ -0.8
RIF1P29539 PGC1YPL206C 966 nt10.03□□□□□ -0.8
RIF1P29539 LIP1YMR298W 453 nt10.02□□□□□ -0.81
RIF1P29539 YBL086CYBL086C 1401 nt10□□□□□ -0.81
RIF1P29539 YER190C-AYER190C-A 576 nt10□□□□□ -0.81
RIF1P29539 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10□□□□□ -0.81
RIF1P29539 YML133W-AYML133W-A 576 nt10□□□□□ -0.81
RIF1P29539 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10□□□□□ -0.81
RIF1P29539 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10□□□□□ -0.81
RIF1P29539 NUC1YJL208C 990 nt9.97□□□□□ -0.81
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