Protein–RNA interactions for Protein: P29056

BRF1, Transcription factor IIIB 70 kDa subunit, yeastyeast

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRF1P29056 YCL074WYCL074W 927 nt10.19□□□□□ -0.78
BRF1P29056 DUT1YBR252W 444 nt10.19□□□□□ -0.78
BRF1P29056 RET2YFR051C 1641 nt10.18□□□□□ -0.78
BRF1P29056 XYL2YLR070C 1071 nt10.18□□□□□ -0.78
BRF1P29056 DUS1YML080W 1272 nt10.18□□□□□ -0.78
BRF1P29056 ESBP6YNL125C 2022 nt10.17□□□□□ -0.78
BRF1P29056 PHO89YBR296C 1725 nt10.17□□□□□ -0.78
BRF1P29056 YGR259CYGR259C 441 nt10.15□□□□□ -0.78
BRF1P29056 MAE1YKL029C 2010 nt10.14□□□□□ -0.79
BRF1P29056 YCR102CYCR102C 1107 nt10.14□□□□□ -0.79
BRF1P29056 YCR087WYCR087W 516 nt10.13□□□□□ -0.79
BRF1P29056 IRC24YIR036C 792 nt10.13□□□□□ -0.79
BRF1P29056 SNF1YDR477W 1902 nt10.13□□□□□ -0.79
BRF1P29056 NDI1YML120C 1542 nt10.12□□□□□ -0.79
BRF1P29056 RBG1YAL036C 1110 nt10.12□□□□□ -0.79
BRF1P29056 HMG2YLR450W 3138 nt10.11□□□□□ -0.79
BRF1P29056 TPO4YOR273C 1980 nt10.08□□□□□ -0.8
BRF1P29056 RBG2YGR173W 1107 nt10.08□□□□□ -0.8
BRF1P29056 AIM45YPR004C 1035 nt10.08□□□□□ -0.8
BRF1P29056 RIM8YGL045W 1629 nt10.07□□□□□ -0.8
BRF1P29056 SFA1YDL168W 1161 nt10.05□□□□□ -0.8
BRF1P29056 MRP20YDR405W 792 nt10.05□□□□□ -0.8
BRF1P29056 COQ2YNR041C 1119 nt10.04□□□□□ -0.8
BRF1P29056 NBP35YGL091C 987 nt10.02□□□□□ -0.81
BRF1P29056 UGA4YDL210W 1716 nt10.02□□□□□ -0.81
BRF1P29056 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.01□□□□□ -0.81
BRF1P29056 STR3YGL184C 1398 nt10□□□□□ -0.81
BRF1P29056 DTR1YBR180W 1719 nt9.99□□□□□ -0.81
BRF1P29056 AQY2YLL052C 450 nt9.98□□□□□ -0.81
BRF1P29056 YMR226CYMR226C 804 nt9.98□□□□□ -0.81
BRF1P29056 YGL114WYGL114W 2178 nt9.97□□□□□ -0.81
BRF1P29056 TIR3YIL011W 810 nt9.97□□□□□ -0.81
BRF1P29056 SHH4YLR164W 507 nt9.97□□□□□ -0.81
BRF1P29056 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.96□□□□□ -0.81
BRF1P29056 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.96□□□□□ -0.81
BRF1P29056 HEM14YER014W 1620 nt9.95□□□□□ -0.82
BRF1P29056 ILV2YMR108W 2064 nt9.94□□□□□ -0.82
BRF1P29056 SPT20YOL148C 1815 nt9.93□□□□□ -0.82
BRF1P29056 RPL4BYDR012W 1089 nt9.92□□□□□ -0.82
BRF1P29056 RPL4AYBR031W 1089 nt9.92□□□□□ -0.82
BRF1P29056 URA8YJR103W 1737 nt9.91□□□□□ -0.82
BRF1P29056 RTN2YDL204W 1182 nt9.9□□□□□ -0.82
BRF1P29056 TOM6YOR045W 186 nt9.89□□□□□ -0.83
BRF1P29056 ACO2YJL200C 2370 nt9.88□□□□□ -0.83
BRF1P29056 CLB6YGR109C 1143 nt9.88□□□□□ -0.83
BRF1P29056 POM34YLR018C 900 nt9.88□□□□□ -0.83
BRF1P29056 RFC1YOR217W 2586 nt9.87□□□□□ -0.83
BRF1P29056 LSC2YGR244C 1284 nt9.86□□□□□ -0.83
BRF1P29056 RPS14BYJL191W 417 nt9.86□□□□□ -0.83
BRF1P29056 PRO1YDR300C 1287 nt9.85□□□□□ -0.83
BRF1P29056 PEX2YJL210W 816 nt9.85□□□□□ -0.83
BRF1P29056 SAM1YLR180W 1149 nt9.85□□□□□ -0.83
BRF1P29056 YML089CYML089C 369 nt9.85□□□□□ -0.83
BRF1P29056 UTH1YKR042W 1098 nt9.84□□□□□ -0.83
BRF1P29056 GTB1YDR221W 2109 nt9.83□□□□□ -0.84
BRF1P29056 HIP1YGR191W 1812 nt9.83□□□□□ -0.84
BRF1P29056 MCM5YLR274W 2328 nt9.82□□□□□ -0.84
BRF1P29056 YLR111WYLR111W 333 nt9.82□□□□□ -0.84
BRF1P29056 SDH5YOL071W 489 nt9.82□□□□□ -0.84
BRF1P29056 ARP6YLR085C 1317 nt9.81□□□□□ -0.84
BRF1P29056 ATG15YCR068W 1563 nt9.8□□□□□ -0.84
BRF1P29056 NRT1YOR071C 1797 nt9.78□□□□□ -0.84
BRF1P29056 TIF6YPR016C 738 nt9.77□□□□□ -0.85
BRF1P29056 MET28YIR017C 564 nt9.76□□□□□ -0.85
BRF1P29056 MAS1YLR163C 1389 nt9.75□□□□□ -0.85
BRF1P29056 RSC4YKR008W 1878 nt9.74□□□□□ -0.85
BRF1P29056 RAD23YEL037C 1197 nt9.74□□□□□ -0.85
BRF1P29056 TSC10YBR265W 963 nt9.74□□□□□ -0.85
BRF1P29056 GAP1YKR039W 1809 nt9.74□□□□□ -0.85
BRF1P29056 PLB1YMR008C 1995 nt9.73□□□□□ -0.85
BRF1P29056 YGR012WYGR012W 1182 nt9.71□□□□□ -0.86
BRF1P29056 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.7□□□□□ -0.86
BRF1P29056 GAL2YLR081W 1725 nt9.69□□□□□ -0.86
BRF1P29056 THI72YOR192C 1800 nt9.68□□□□□ -0.86
BRF1P29056 MUP1YGR055W 1725 nt9.68□□□□□ -0.86
BRF1P29056 CAB5YDR196C 726 nt9.66□□□□□ -0.86
BRF1P29056 YLR279WYLR279W 390 nt9.66□□□□□ -0.86
BRF1P29056 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.66□□□□□ -0.86
BRF1P29056 FIT3YOR383C 615 nt9.66□□□□□ -0.86
BRF1P29056 RPC82YPR190C 1965 nt9.66□□□□□ -0.86
BRF1P29056 RIB3YDR487C 627 nt9.64□□□□□ -0.87
BRF1P29056 ALD4YOR374W 1560 nt9.63□□□□□ -0.87
BRF1P29056 INA1YLR413W 2028 nt9.63□□□□□ -0.87
BRF1P29056 HIF1YLL022C 1158 nt9.62□□□□□ -0.87
BRF1P29056 MSB4YOL112W 1479 nt9.6□□□□□ -0.87
BRF1P29056 UTR1YJR049C 1593 nt9.6□□□□□ -0.87
BRF1P29056 DIF1YLR437C 402 nt9.6□□□□□ -0.87
BRF1P29056 TOK1YJL093C 2076 nt9.6□□□□□ -0.87
BRF1P29056 PRM5YIL117C 957 nt9.57□□□□□ -0.88
BRF1P29056 YAR028WYAR028W 705 nt9.57□□□□□ -0.88
BRF1P29056 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.57□□□□□ -0.88
BRF1P29056 RAD51YER095W 1203 nt9.55□□□□□ -0.88
BRF1P29056 STE4YOR212W 1272 nt9.55□□□□□ -0.88
BRF1P29056 ALP1YNL270C 1722 nt9.53□□□□□ -0.88
BRF1P29056 YHL008CYHL008C 1884 nt9.53□□□□□ -0.88
BRF1P29056 ZTA1YBR046C 1005 nt9.53□□□□□ -0.88
BRF1P29056 MTG2YHR168W 1557 nt9.53□□□□□ -0.88
BRF1P29056 AKR2YOR034C 2250 nt9.52□□□□□ -0.89
BRF1P29056 YNR029CYNR029C 1290 nt9.51□□□□□ -0.89
BRF1P29056 SAM35YHR083W 990 nt9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 77.9 ms