Protein–RNA interactions for Protein: P27801

PEP3, Vacuolar membrane protein PEP3, yeastyeast

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PEP3P27801 TOM6YOR045W 186 nt11.55□□□□□ -0.56
PEP3P27801 PLB1YMR008C 1995 nt11.54□□□□□ -0.56
PEP3P27801 LSC2YGR244C 1284 nt11.54□□□□□ -0.56
PEP3P27801 NDI1YML120C 1542 nt11.52□□□□□ -0.57
PEP3P27801 ATG15YCR068W 1563 nt11.49□□□□□ -0.57
PEP3P27801 PEX2YJL210W 816 nt11.48□□□□□ -0.57
PEP3P27801 YML089CYML089C 369 nt11.47□□□□□ -0.57
PEP3P27801 GAP1YKR039W 1809 nt11.46□□□□□ -0.57
PEP3P27801 AAC1YMR056C 930 nt11.46□□□□□ -0.57
PEP3P27801 RPL4BYDR012W 1089 nt11.44□□□□□ -0.58
PEP3P27801 RPL4AYBR031W 1089 nt11.44□□□□□ -0.58
PEP3P27801 HIP1YGR191W 1812 nt11.44□□□□□ -0.58
PEP3P27801 SNF1YDR477W 1902 nt11.43□□□□□ -0.58
PEP3P27801 IRC24YIR036C 792 nt11.43□□□□□ -0.58
PEP3P27801 GLR1YPL091W 1452 nt11.41□□□□□ -0.58
PEP3P27801 TIF6YPR016C 738 nt11.4□□□□□ -0.58
PEP3P27801 CLB6YGR109C 1143 nt11.39□□□□□ -0.59
PEP3P27801 RPS14BYJL191W 417 nt11.39□□□□□ -0.59
PEP3P27801 UTH1YKR042W 1098 nt11.38□□□□□ -0.59
PEP3P27801 UTR1YJR049C 1593 nt11.37□□□□□ -0.59
PEP3P27801 YMR244WYMR244W 1068 nt11.37□□□□□ -0.59
PEP3P27801 NRT1YOR071C 1797 nt11.35□□□□□ -0.59
PEP3P27801 MET28YIR017C 564 nt11.33□□□□□ -0.6
PEP3P27801 PRM5YIL117C 957 nt11.32□□□□□ -0.6
PEP3P27801 DIF1YLR437C 402 nt11.29□□□□□ -0.6
PEP3P27801 SDH5YOL071W 489 nt11.29□□□□□ -0.6
PEP3P27801 BIO5YNR056C 1686 nt11.29□□□□□ -0.6
PEP3P27801 ALG12YNR030W 1656 nt11.28□□□□□ -0.6
PEP3P27801 TSC10YBR265W 963 nt11.22□□□□□ -0.61
PEP3P27801 SAM35YHR083W 990 nt11.21□□□□□ -0.61
PEP3P27801 YAR028WYAR028W 705 nt11.21□□□□□ -0.61
PEP3P27801 FIT3YOR383C 615 nt11.2□□□□□ -0.62
PEP3P27801 YGR012WYGR012W 1182 nt11.19□□□□□ -0.62
PEP3P27801 YLR111WYLR111W 333 nt11.19□□□□□ -0.62
PEP3P27801 ALD4YOR374W 1560 nt11.17□□□□□ -0.62
PEP3P27801 RBG2YGR173W 1107 nt11.17□□□□□ -0.62
PEP3P27801 ZTA1YBR046C 1005 nt11.17□□□□□ -0.62
PEP3P27801 YLR279WYLR279W 390 nt11.16□□□□□ -0.62
PEP3P27801 UME6YDR207C 2511 nt11.16□□□□□ -0.62
PEP3P27801 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.16□□□□□ -0.62
PEP3P27801 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.16□□□□□ -0.62
PEP3P27801 MTG2YHR168W 1557 nt11.16□□□□□ -0.62
PEP3P27801 HIF1YLL022C 1158 nt11.15□□□□□ -0.62
PEP3P27801 YMR226CYMR226C 804 nt11.15□□□□□ -0.62
PEP3P27801 AKR2YOR034C 2250 nt11.14□□□□□ -0.63
PEP3P27801 RAD23YEL037C 1197 nt11.13□□□□□ -0.63
PEP3P27801 MSB4YOL112W 1479 nt11.12□□□□□ -0.63
PEP3P27801 ALP1YNL270C 1722 nt11.12□□□□□ -0.63
PEP3P27801 CAB5YDR196C 726 nt11.11□□□□□ -0.63
PEP3P27801 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.1□□□□□ -0.63
PEP3P27801 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.1□□□□□ -0.63
PEP3P27801 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.1□□□□□ -0.63
PEP3P27801 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.1□□□□□ -0.63
PEP3P27801 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.1□□□□□ -0.63
PEP3P27801 SED1YDR077W 1017 nt11.07□□□□□ -0.64
PEP3P27801 DBP1YPL119C 1854 nt11.06□□□□□ -0.64
PEP3P27801 PBP1YGR178C 2169 nt11.04□□□□□ -0.64
PEP3P27801 HXT1YHR094C 1713 nt11.04□□□□□ -0.64
PEP3P27801 LIP1YMR298W 453 nt11.04□□□□□ -0.64
PEP3P27801 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt11.03□□□□□ -0.64
PEP3P27801 NAR1YNL240C 1476 nt11.03□□□□□ -0.64
PEP3P27801 RIB3YDR487C 627 nt11.02□□□□□ -0.65
PEP3P27801 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.01□□□□□ -0.65
PEP3P27801 YBL086CYBL086C 1401 nt11□□□□□ -0.65
PEP3P27801 CYT2YKL087C 675 nt10.96□□□□□ -0.65
PEP3P27801 YPL251WYPL251W 303 nt10.95□□□□□ -0.66
PEP3P27801 SAM1YLR180W 1149 nt10.93□□□□□ -0.66
PEP3P27801 MCH5YOR306C 1566 nt10.93□□□□□ -0.66
PEP3P27801 UGA4YDL210W 1716 nt10.92□□□□□ -0.66
PEP3P27801 SHY1YGR112W 1170 nt10.91□□□□□ -0.66
PEP3P27801 BRR1YPR057W 1026 nt10.91□□□□□ -0.66
PEP3P27801 LEU9YOR108W 1815 nt10.91□□□□□ -0.66
PEP3P27801 TOA2YKL058W 369 nt10.9□□□□□ -0.66
PEP3P27801 GND1YHR183W 1470 nt10.89□□□□□ -0.67
PEP3P27801 FCY21YER060W 1587 nt10.89□□□□□ -0.67
PEP3P27801 ZRT3YKL175W 1512 nt10.89□□□□□ -0.67
PEP3P27801 LOT5YKL183W 921 nt10.88□□□□□ -0.67
PEP3P27801 MEP3YPR138C 1470 nt10.87□□□□□ -0.67
PEP3P27801 YMR103CYMR103C 363 nt10.87□□□□□ -0.67
PEP3P27801 SMM1YNR015W 1155 nt10.86□□□□□ -0.67
PEP3P27801 GND2YGR256W 1479 nt10.84□□□□□ -0.67
PEP3P27801 UFO1YML088W 2007 nt10.83□□□□□ -0.68
PEP3P27801 APT2YDR441C 546 nt10.81□□□□□ -0.68
PEP3P27801 PRY1YJL079C 900 nt10.81□□□□□ -0.68
PEP3P27801 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.8□□□□□ -0.68
PEP3P27801 YJL067WYJL067W 351 nt10.79□□□□□ -0.68
PEP3P27801 URA6YKL024C 615 nt10.79□□□□□ -0.68
PEP3P27801 YAT1YAR035W 2064 nt10.79□□□□□ -0.68
PEP3P27801 YPI1YFR003C 468 nt10.76□□□□□ -0.69
PEP3P27801 OYE3YPL171C 1203 nt10.76□□□□□ -0.69
PEP3P27801 SSN3YPL042C 1668 nt10.74□□□□□ -0.69
PEP3P27801 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.74□□□□□ -0.69
PEP3P27801 ADH1YOL086C 1047 nt10.73□□□□□ -0.69
PEP3P27801 SAM2YDR502C 1155 nt10.72□□□□□ -0.69
PEP3P27801 YNR029CYNR029C 1290 nt10.72□□□□□ -0.69
PEP3P27801 CSM1YCR086W 573 nt10.7□□□□□ -0.7
PEP3P27801 PET8YNL003C 855 nt10.7□□□□□ -0.7
PEP3P27801 BNI5YNL166C 1347 nt10.69□□□□□ -0.7
PEP3P27801 RIB2YOL066C 1776 nt10.69□□□□□ -0.7
PEP3P27801 YJL055WYJL055W 738 nt10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.2 ms