Protein–RNA interactions for Protein: P15179

MSD1, Aspartate--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSD1P15179 PRP4YPR178W 1398 nt10.65□□□□□ -0.71
MSD1P15179 UTH1YKR042W 1098 nt10.64□□□□□ -0.71
MSD1P15179 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.63□□□□□ -0.71
MSD1P15179 MCH5YOR306C 1566 nt10.63□□□□□ -0.71
MSD1P15179 YLR349WYLR349W 507 nt10.62□□□□□ -0.71
MSD1P15179 AGP1YCL025C 1902 nt10.62□□□□□ -0.71
MSD1P15179 TSC10YBR265W 963 nt10.6□□□□□ -0.71
MSD1P15179 ADH7YCR105W 1086 nt10.58□□□□□ -0.72
MSD1P15179 DPS1YLL018C 1674 nt10.57□□□□□ -0.72
MSD1P15179 RIB3YDR487C 627 nt10.57□□□□□ -0.72
MSD1P15179 YGR012WYGR012W 1182 nt10.57□□□□□ -0.72
MSD1P15179 FUN14YAL008W 597 nt10.56□□□□□ -0.72
MSD1P15179 AAC1YMR056C 930 nt10.56□□□□□ -0.72
MSD1P15179 TIR3YIL011W 810 nt10.55□□□□□ -0.72
MSD1P15179 PAU15YIR041W 375 nt10.55□□□□□ -0.72
MSD1P15179 YKR005CYKR005C 1578 nt10.53□□□□□ -0.72
MSD1P15179 YJL195CYJL195C 702 nt10.53□□□□□ -0.72
MSD1P15179 DUS1YML080W 1272 nt10.53□□□□□ -0.72
MSD1P15179 DUT1YBR252W 444 nt10.53□□□□□ -0.72
MSD1P15179 CAB5YDR196C 726 nt10.51□□□□□ -0.73
MSD1P15179 SHH4YLR164W 507 nt10.51□□□□□ -0.73
MSD1P15179 TOM6YOR045W 186 nt10.51□□□□□ -0.73
MSD1P15179 NRT1YOR071C 1797 nt10.51□□□□□ -0.73
MSD1P15179 YCL074WYCL074W 927 nt10.5□□□□□ -0.73
MSD1P15179 NBP35YGL091C 987 nt10.5□□□□□ -0.73
MSD1P15179 YLR279WYLR279W 390 nt10.5□□□□□ -0.73
MSD1P15179 HIP1YGR191W 1812 nt10.49□□□□□ -0.73
MSD1P15179 PEX2YJL210W 816 nt10.49□□□□□ -0.73
MSD1P15179 BMT6YLR063W 1098 nt10.49□□□□□ -0.73
MSD1P15179 SNF1YDR477W 1902 nt10.46□□□□□ -0.73
MSD1P15179 YML089CYML089C 369 nt10.46□□□□□ -0.73
MSD1P15179 YGR259CYGR259C 441 nt10.44□□□□□ -0.74
MSD1P15179 MET28YIR017C 564 nt10.44□□□□□ -0.74
MSD1P15179 POM34YLR018C 900 nt10.44□□□□□ -0.74
MSD1P15179 BIO5YNR056C 1686 nt10.44□□□□□ -0.74
MSD1P15179 ADH1YOL086C 1047 nt10.42□□□□□ -0.74
MSD1P15179 NAR1YNL240C 1476 nt10.42□□□□□ -0.74
MSD1P15179 YPI1YFR003C 468 nt10.41□□□□□ -0.74
MSD1P15179 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.4□□□□□ -0.74
MSD1P15179 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.4□□□□□ -0.74
MSD1P15179 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.4□□□□□ -0.74
MSD1P15179 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.4□□□□□ -0.75
MSD1P15179 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.4□□□□□ -0.75
MSD1P15179 LSC2YGR244C 1284 nt10.39□□□□□ -0.75
MSD1P15179 GPN2YOR262W 1044 nt10.39□□□□□ -0.75
MSD1P15179 TIF6YPR016C 738 nt10.38□□□□□ -0.75
MSD1P15179 PRO1YDR300C 1287 nt10.37□□□□□ -0.75
MSD1P15179 YEL008WYEL008W 381 nt10.37□□□□□ -0.75
MSD1P15179 FIT3YOR383C 615 nt10.37□□□□□ -0.75
MSD1P15179 CPD1YGR247W 720 nt10.36□□□□□ -0.75
MSD1P15179 MSB4YOL112W 1479 nt10.36□□□□□ -0.75
MSD1P15179 ATG15YCR068W 1563 nt10.35□□□□□ -0.75
MSD1P15179 STR3YGL184C 1398 nt10.35□□□□□ -0.75
MSD1P15179 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10.34□□□□□ -0.75
MSD1P15179 ESS1YJR017C 513 nt10.34□□□□□ -0.75
MSD1P15179 IRC24YIR036C 792 nt10.33□□□□□ -0.76
MSD1P15179 AQY2YLL052C 450 nt10.33□□□□□ -0.76
MSD1P15179 LOT5YKL183W 921 nt10.3□□□□□ -0.76
MSD1P15179 PBP1YGR178C 2169 nt10.29□□□□□ -0.76
MSD1P15179 GND1YHR183W 1470 nt10.29□□□□□ -0.76
MSD1P15179 CYT2YKL087C 675 nt10.25□□□□□ -0.77
MSD1P15179 NAP1YKR048C 1254 nt10.23□□□□□ -0.77
MSD1P15179 ARP6YLR085C 1317 nt10.19□□□□□ -0.78
MSD1P15179 RTN2YDL204W 1182 nt10.19□□□□□ -0.78
MSD1P15179 APT2YDR441C 546 nt10.18□□□□□ -0.78
MSD1P15179 SEN2YLR105C 1134 nt10.18□□□□□ -0.78
MSD1P15179 GAP1YKR039W 1809 nt10.18□□□□□ -0.78
MSD1P15179 YGR139WYGR139W 339 nt10.16□□□□□ -0.78
MSD1P15179 ALP1YNL270C 1722 nt10.13□□□□□ -0.79
MSD1P15179 PUP1YOR157C 786 nt10.13□□□□□ -0.79
MSD1P15179 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.13□□□□□ -0.79
MSD1P15179 SMM1YNR015W 1155 nt10.12□□□□□ -0.79
MSD1P15179 YAR028WYAR028W 705 nt10.11□□□□□ -0.79
MSD1P15179 AKR2YOR034C 2250 nt10.09□□□□□ -0.79
MSD1P15179 RIB2YOL066C 1776 nt10.07□□□□□ -0.8
MSD1P15179 ZTA1YBR046C 1005 nt10.07□□□□□ -0.8
MSD1P15179 YAT1YAR035W 2064 nt10.05□□□□□ -0.8
MSD1P15179 FCY21YER060W 1587 nt10.05□□□□□ -0.8
MSD1P15179 DIF1YLR437C 402 nt10.04□□□□□ -0.8
MSD1P15179 PLB1YMR008C 1995 nt10.03□□□□□ -0.8
MSD1P15179 FRE6YLL051C 2139 nt10.03□□□□□ -0.8
MSD1P15179 PAU5YFL020C 369 nt10.03□□□□□ -0.8
MSD1P15179 MTG2YHR168W 1557 nt10.03□□□□□ -0.8
MSD1P15179 PGC1YPL206C 966 nt10.03□□□□□ -0.8
MSD1P15179 YBR232CYBR232C 360 nt10.01□□□□□ -0.81
MSD1P15179 STP3YLR375W 1032 nt10□□□□□ -0.81
MSD1P15179 HXT12YIL170W 1374 nt10□□□□□ -0.81
MSD1P15179 CMP2YML057W 1815 nt9.99□□□□□ -0.81
MSD1P15179 VRG4YGL225W 1014 nt9.98□□□□□ -0.81
MSD1P15179 PRM5YIL117C 957 nt9.97□□□□□ -0.81
MSD1P15179 PRY1YJL079C 900 nt9.97□□□□□ -0.81
MSD1P15179 YJL064WYJL064W 396 nt9.96□□□□□ -0.82
MSD1P15179 HIF1YLL022C 1158 nt9.95□□□□□ -0.82
MSD1P15179 ALD4YOR374W 1560 nt9.94□□□□□ -0.82
MSD1P15179 TIM44YIL022W 1296 nt9.94□□□□□ -0.82
MSD1P15179 PAU19YMR325W 375 nt9.93□□□□□ -0.82
MSD1P15179 MET8YBR213W 825 nt9.93□□□□□ -0.82
MSD1P15179 HSL7YBR133C 2484 nt9.93□□□□□ -0.82
MSD1P15179 UTR1YJR049C 1593 nt9.91□□□□□ -0.82
MSD1P15179 CCT5YJR064W 1689 nt9.9□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.2 ms