Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms