Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF12Q9Y4X4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF12Q9Y4X4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms