Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOP58Q9Y2X3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms