Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM106CQ9BVX2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms