Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLMNQ96JQ2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLMNQ96JQ2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms