Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE12Q6L8Q7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE12Q6L8Q7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE12Q6L8Q7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE12Q6L8Q7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE12Q6L8Q7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE12Q6L8Q7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE12Q6L8Q7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE12Q6L8Q7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE12Q6L8Q7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE12Q6L8Q7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE12Q6L8Q7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE12Q6L8Q7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE12Q6L8Q7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE12Q6L8Q7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE12Q6L8Q7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE12Q6L8Q7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE12Q6L8Q7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE12Q6L8Q7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE12Q6L8Q7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE12Q6L8Q7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE12Q6L8Q7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE12Q6L8Q7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE12Q6L8Q7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE12Q6L8Q7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE12Q6L8Q7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE12Q6L8Q7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE12Q6L8Q7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE12Q6L8Q7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE12Q6L8Q7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE12Q6L8Q7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE12Q6L8Q7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE12Q6L8Q7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.7 ms