Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPO2Q5TGU0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms