Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC18A3Q16572 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC18A3Q16572 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
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