Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRKQ15262 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
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PTPRKQ15262 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
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PTPRKQ15262 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
PTPRKQ15262 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
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