Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCAN1P53805 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RCAN1P53805 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RCAN1P53805 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RCAN1P53805 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RCAN1P53805 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN1P53805 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN1P53805 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN1P53805 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN1P53805 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCAN1P53805 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms