Protein–RNA interactions for Protein: P53277

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF2P53277 RMD1YDL001W 1293 nt3.18□□□□□ -1.9
SYF2P53277 OTU1YFL044C 906 nt3.18□□□□□ -1.9
SYF2P53277 YJR037WYJR037W 384 nt3.18□□□□□ -1.9
SYF2P53277 MSA2YKR077W 1092 nt3.18□□□□□ -1.9
SYF2P53277 RPL22AYLR061W 366 nt3.18□□□□□ -1.9
SYF2P53277 RUF21RUF21 707 nt3.18□□□□□ -1.9
SYF2P53277 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.18□□□□□ -1.9
SYF2P53277 SCD6YPR129W 1050 nt3.18□□□□□ -1.9
SYF2P53277 snR34snR34 203 nt3.18□□□□□ -1.9
SYF2P53277 AIM14YGL160W 1713 nt3.18□□□□□ -1.9
SYF2P53277 BMS1YPL217C 3552 nt3.18□□□□□ -1.9
SYF2P53277 RNY1YPL123C 1305 nt3.18□□□□□ -1.9
SYF2P53277 YBR238CYBR238C 2196 nt3.17□□□□□ -1.9
SYF2P53277 YCR085WYCR085W 354 nt3.17□□□□□ -1.9
SYF2P53277 AAD3YCR107W 1092 nt3.17□□□□□ -1.9
SYF2P53277 MAF1YDR005C 1188 nt3.17□□□□□ -1.9
SYF2P53277 PHM6YDR281C 315 nt3.17□□□□□ -1.9
SYF2P53277 RPS18AYDR450W 441 nt3.17□□□□□ -1.9
SYF2P53277 PDX1YGR193C 1233 nt3.17□□□□□ -1.9
SYF2P53277 SPO16YHR153C 597 nt3.17□□□□□ -1.9
SYF2P53277 YIL086CYIL086C 309 nt3.17□□□□□ -1.9
SYF2P53277 GCD7YLR291C 1146 nt3.17□□□□□ -1.9
SYF2P53277 DDP1YOR163W 567 nt3.17□□□□□ -1.9
SYF2P53277 PLP2YOR281C 861 nt3.17□□□□□ -1.9
SYF2P53277 snR17asnR17a 333 nt3.17□□□□□ -1.9
SYF2P53277 TMA108YIL137C 2841 nt3.17□□□□□ -1.9
SYF2P53277 CPA2YJR109C 3357 nt3.17□□□□□ -1.9
SYF2P53277 MYO3YKL129C 3819 nt3.16□□□□□ -1.9
SYF2P53277 SLM2YNL047C 1971 nt3.16□□□□□ -1.9
SYF2P53277 RSC1YGR056W 2787 nt3.16□□□□□ -1.9
SYF2P53277 MCM21YDR318W 1107 nt3.16□□□□□ -1.9
SYF2P53277 PHO92YDR374C 921 nt3.16□□□□□ -1.9
SYF2P53277 YLR326WYLR326W 723 nt3.16□□□□□ -1.9
SYF2P53277 RAD33YML011C 534 nt3.16□□□□□ -1.9
SYF2P53277 FES1YBR101C 873 nt3.16□□□□□ -1.9
SYF2P53277 OAF3YKR064W 2592 nt3.16□□□□□ -1.9
SYF2P53277 YJR030CYJR030C 2238 nt3.16□□□□□ -1.9
SYF2P53277 NUP60YAR002W 1620 nt3.15□□□□□ -1.9
SYF2P53277 UBP12YJL197W 3765 nt3.15□□□□□ -1.9
SYF2P53277 FAP7YDL166C 594 nt3.15□□□□□ -1.91
SYF2P53277 TRP4YDR354W 1143 nt3.15□□□□□ -1.91
SYF2P53277 CLC1YGR167W 702 nt3.15□□□□□ -1.91
SYF2P53277 ARD1YHR013C 717 nt3.15□□□□□ -1.91
SYF2P53277 CDA2YLR308W 939 nt3.15□□□□□ -1.91
SYF2P53277 ERD2YBL040C 660 nt3.15□□□□□ -1.91
SYF2P53277 IMP1YMR150C 573 nt3.15□□□□□ -1.91
SYF2P53277 LTO1YNL260C 597 nt3.15□□□□□ -1.91
SYF2P53277 SUI3YPL237W 858 nt3.15□□□□□ -1.91
SYF2P53277 REB1YBR049C 2433 nt3.15□□□□□ -1.91
SYF2P53277 IMD4YML056C 1575 nt3.15□□□□□ -1.91
SYF2P53277 PRP22YER013W 3438 nt3.15□□□□□ -1.91
SYF2P53277 MRH4YGL064C 1686 nt3.14□□□□□ -1.91
SYF2P53277 SER3YER081W 1410 nt3.14□□□□□ -1.91
SYF2P53277 YCR101CYCR101C 549 nt3.14□□□□□ -1.91
SYF2P53277 RCR2YDR003W 633 nt3.14□□□□□ -1.91
SYF2P53277 YOR186WYOR186W 435 nt3.14□□□□□ -1.91
SYF2P53277 YOR338WYOR338W 1092 nt3.14□□□□□ -1.91
SYF2P53277 FLO10YKR102W 3510 nt3.14□□□□□ -1.91
SYF2P53277 MDM38YOL027C 1722 nt3.13□□□□□ -1.91
SYF2P53277 ORC4YPR162C 1590 nt3.13□□□□□ -1.91
SYF2P53277 PRP3YDR473C 1410 nt3.13□□□□□ -1.91
SYF2P53277 YCL068CYCL068C 783 nt3.13□□□□□ -1.91
SYF2P53277 PRS5YOL061W 1491 nt3.13□□□□□ -1.91
SYF2P53277 ZDS2YML109W 2829 nt3.13□□□□□ -1.91
SYF2P53277 ISM1YPL040C 3009 nt3.13□□□□□ -1.91
SYF2P53277 CUS1YMR240C 1311 nt3.13□□□□□ -1.91
SYF2P53277 HEF3YNL014W 3135 nt3.13□□□□□ -1.91
SYF2P53277 GAT2YMR136W 1683 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 GWT1YJL091C 1473 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 YDR133CYDR133C 336 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 RPB7YDR404C 516 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 GTF1YGR102C 552 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 YKL071WYKL071W 771 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 SPC3YLR066W 555 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 YAR070CYAR070C 300 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 CPR3YML078W 549 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 PSF3YOL146W 585 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 CNS1YBR155W 1158 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 RRN7YJL025W 1545 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 PWP2YCR057C 2772 nt3.12□□□□□ -1.91
SYF2P53277 YHL012WYHL012W 1482 nt3.11□□□□□ -1.91
SYF2P53277 VPS53YJL029C 2469 nt3.11□□□□□ -1.91
SYF2P53277 RTS1YOR014W 2274 nt3.11□□□□□ -1.91
SYF2P53277 BAR1YIL015W 1764 nt3.11□□□□□ -1.91
SYF2P53277 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt3.11□□□□□ -1.91
SYF2P53277 ECO1YFR027W 846 nt3.11□□□□□ -1.91
SYF2P53277 COS8YHL048W 1146 nt3.11□□□□□ -1.91
SYF2P53277 EMG1YLR186W 759 nt3.11□□□□□ -1.91
SYF2P53277 TPM1YNL079C 600 nt3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 87.9 ms