Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDKN2BP42772 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN2BP42772 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms