Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
GTF2E1P29083 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTF2E1P29083 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms