Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXD10P28358 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXD10P28358 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms