Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRAP19793 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RXRAP19793 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRAP19793 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRAP19793 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRAP19793 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRAP19793 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRAP19793 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRAP19793 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRAP19793 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRAP19793 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRAP19793 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRAP19793 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRAP19793 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRAP19793 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RXRAP19793 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RXRAP19793 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RXRAP19793 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RXRAP19793 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RXRAP19793 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RXRAP19793 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RXRAP19793 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RXRAP19793 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RXRAP19793 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RXRAP19793 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RXRAP19793 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RXRAP19793 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RXRAP19793 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RXRAP19793 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RXRAP19793 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RXRAP19793 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RXRAP19793 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RXRAP19793 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RXRAP19793 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RXRAP19793 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RXRAP19793 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RXRAP19793 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RXRAP19793 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RXRAP19793 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RXRAP19793 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RXRAP19793 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RXRAP19793 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RXRAP19793 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RXRAP19793 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RXRAP19793 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RXRAP19793 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RXRAP19793 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RXRAP19793 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RXRAP19793 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RXRAP19793 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RXRAP19793 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RXRAP19793 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RXRAP19793 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RXRAP19793 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RXRAP19793 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RXRAP19793 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RXRAP19793 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RXRAP19793 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RXRAP19793 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RXRAP19793 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RXRAP19793 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RXRAP19793 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RXRAP19793 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RXRAP19793 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RXRAP19793 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RXRAP19793 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RXRAP19793 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RXRAP19793 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RXRAP19793 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RXRAP19793 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RXRAP19793 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RXRAP19793 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RXRAP19793 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RXRAP19793 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RXRAP19793 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RXRAP19793 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RXRAP19793 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RXRAP19793 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RXRAP19793 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RXRAP19793 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RXRAP19793 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RXRAP19793 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RXRAP19793 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RXRAP19793 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RXRAP19793 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RXRAP19793 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RXRAP19793 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RXRAP19793 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RXRAP19793 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RXRAP19793 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RXRAP19793 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RXRAP19793 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RXRAP19793 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RXRAP19793 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RXRAP19793 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RXRAP19793 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RXRAP19793 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RXRAP19793 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RXRAP19793 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RXRAP19793 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms