Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBSP08397 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBSP08397 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBSP08397 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBSP08397 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBSP08397 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBSP08397 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBSP08397 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBSP08397 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBSP08397 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBSP08397 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBSP08397 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBSP08397 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBSP08397 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBSP08397 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBSP08397 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBSP08397 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBSP08397 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBSP08397 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBSP08397 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBSP08397 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBSP08397 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBSP08397 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBSP08397 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBSP08397 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBSP08397 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBSP08397 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBSP08397 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBSP08397 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBSP08397 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBSP08397 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBSP08397 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBSP08397 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBSP08397 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBSP08397 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBSP08397 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBSP08397 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBSP08397 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBSP08397 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBSP08397 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBSP08397 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBSP08397 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBSP08397 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBSP08397 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBSP08397 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMBSP08397 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMBSP08397 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMBSP08397 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMBSP08397 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMBSP08397 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMBSP08397 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMBSP08397 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMBSP08397 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMBSP08397 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMBSP08397 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMBSP08397 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBSP08397 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBSP08397 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBSP08397 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBSP08397 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBSP08397 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBSP08397 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBSP08397 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBSP08397 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBSP08397 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMBSP08397 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMBSP08397 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMBSP08397 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMBSP08397 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMBSP08397 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMBSP08397 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMBSP08397 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMBSP08397 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HMBSP08397 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMBSP08397 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMBSP08397 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMBSP08397 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMBSP08397 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMBSP08397 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMBSP08397 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMBSP08397 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMBSP08397 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBSP08397 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBSP08397 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBSP08397 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBSP08397 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBSP08397 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBSP08397 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBSP08397 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBSP08397 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBSP08397 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBSP08397 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBSP08397 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBSP08397 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBSP08397 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBSP08397 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBSP08397 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBSP08397 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBSP08397 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBSP08397 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms