Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB6O95452 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB6O95452 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB6O95452 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB6O95452 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB6O95452 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB6O95452 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB6O95452 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB6O95452 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB6O95452 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB6O95452 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB6O95452 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB6O95452 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB6O95452 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB6O95452 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB6O95452 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB6O95452 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB6O95452 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB6O95452 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB6O95452 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB6O95452 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB6O95452 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB6O95452 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB6O95452 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB6O95452 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB6O95452 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB6O95452 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB6O95452 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB6O95452 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB6O95452 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB6O95452 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJB6O95452 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJB6O95452 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJB6O95452 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJB6O95452 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB6O95452 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB6O95452 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB6O95452 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB6O95452 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB6O95452 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB6O95452 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB6O95452 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB6O95452 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB6O95452 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB6O95452 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB6O95452 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB6O95452 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB6O95452 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB6O95452 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB6O95452 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB6O95452 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB6O95452 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB6O95452 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB6O95452 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB6O95452 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB6O95452 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB6O95452 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB6O95452 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB6O95452 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB6O95452 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB6O95452 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB6O95452 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB6O95452 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB6O95452 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB6O95452 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB6O95452 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB6O95452 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB6O95452 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB6O95452 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB6O95452 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB6O95452 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB6O95452 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB6O95452 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB6O95452 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB6O95452 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB6O95452 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB6O95452 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB6O95452 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB6O95452 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB6O95452 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB6O95452 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB6O95452 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB6O95452 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB6O95452 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB6O95452 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB6O95452 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB6O95452 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB6O95452 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB6O95452 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB6O95452 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB6O95452 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB6O95452 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms