Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRP12Q9Y561 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRP12Q9Y561 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms