Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CPNE7Q9UBL6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CPNE7Q9UBL6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CPNE7Q9UBL6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CPNE7Q9UBL6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CPNE7Q9UBL6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CPNE7Q9UBL6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CPNE7Q9UBL6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CPNE7Q9UBL6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CPNE7Q9UBL6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CPNE7Q9UBL6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CPNE7Q9UBL6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CPNE7Q9UBL6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CPNE7Q9UBL6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CPNE7Q9UBL6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CPNE7Q9UBL6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CPNE7Q9UBL6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CPNE7Q9UBL6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CPNE7Q9UBL6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CPNE7Q9UBL6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms