Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms