Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS2Q9BXC9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS2Q9BXC9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms