Protein–RNA interactions for Protein: Q99470

SDF2, Stromal cell-derived factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF2Q99470 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDF2Q99470 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDF2Q99470 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDF2Q99470 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDF2Q99470 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDF2Q99470 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDF2Q99470 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDF2Q99470 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDF2Q99470 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDF2Q99470 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDF2Q99470 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDF2Q99470 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDF2Q99470 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SDF2Q99470 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDF2Q99470 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDF2Q99470 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDF2Q99470 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDF2Q99470 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDF2Q99470 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SDF2Q99470 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SDF2Q99470 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDF2Q99470 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms