Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SIRT1Q96EB6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIRT1Q96EB6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms