Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXNL1Q96CM4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms