Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHA9Q7RTU4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.4 ms