Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF38BQ5VTL8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms