Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HNF4GQ14541 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HNF4GQ14541 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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