Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2C1P98194 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms