Protein–RNA interactions for Protein: P55285

CDH6, Cadherin-6, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH6P55285 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH6P55285 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH6P55285 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH6P55285 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH6P55285 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH6P55285 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH6P55285 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH6P55285 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH6P55285 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH6P55285 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH6P55285 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH6P55285 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH6P55285 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH6P55285 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH6P55285 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH6P55285 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH6P55285 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH6P55285 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH6P55285 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH6P55285 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH6P55285 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH6P55285 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH6P55285 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH6P55285 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH6P55285 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH6P55285 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH6P55285 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH6P55285 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH6P55285 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH6P55285 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH6P55285 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH6P55285 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH6P55285 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH6P55285 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH6P55285 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH6P55285 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH6P55285 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH6P55285 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH6P55285 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH6P55285 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH6P55285 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH6P55285 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH6P55285 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH6P55285 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH6P55285 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH6P55285 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH6P55285 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH6P55285 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH6P55285 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH6P55285 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH6P55285 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH6P55285 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH6P55285 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH6P55285 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH6P55285 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH6P55285 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH6P55285 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH6P55285 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH6P55285 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH6P55285 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH6P55285 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH6P55285 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH6P55285 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH6P55285 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH6P55285 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH6P55285 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH6P55285 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH6P55285 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH6P55285 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH6P55285 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH6P55285 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH6P55285 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH6P55285 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH6P55285 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH6P55285 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH6P55285 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH6P55285 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH6P55285 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH6P55285 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH6P55285 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH6P55285 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH6P55285 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH6P55285 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH6P55285 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH6P55285 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH6P55285 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH6P55285 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH6P55285 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH6P55285 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH6P55285 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH6P55285 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH6P55285 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH6P55285 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH6P55285 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH6P55285 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH6P55285 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH6P55285 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH6P55285 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH6P55285 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH6P55285 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms