Protein–RNA interactions for Protein: P50222

MEOX2, Homeobox protein MOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEOX2P50222 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MEOX2P50222 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEOX2P50222 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms