Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DMDP11532 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DMDP11532 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DMDP11532 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DMDP11532 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DMDP11532 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DMDP11532 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DMDP11532 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DMDP11532 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DMDP11532 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DMDP11532 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DMDP11532 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DMDP11532 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DMDP11532 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DMDP11532 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DMDP11532 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DMDP11532 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DMDP11532 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DMDP11532 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DMDP11532 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DMDP11532 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DMDP11532 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DMDP11532 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DMDP11532 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DMDP11532 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DMDP11532 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DMDP11532 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DMDP11532 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DMDP11532 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DMDP11532 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DMDP11532 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DMDP11532 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DMDP11532 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DMDP11532 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DMDP11532 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DMDP11532 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DMDP11532 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DMDP11532 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DMDP11532 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DMDP11532 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DMDP11532 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DMDP11532 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DMDP11532 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DMDP11532 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DMDP11532 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DMDP11532 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DMDP11532 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DMDP11532 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DMDP11532 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DMDP11532 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DMDP11532 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DMDP11532 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DMDP11532 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DMDP11532 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DMDP11532 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DMDP11532 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DMDP11532 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DMDP11532 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DMDP11532 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DMDP11532 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DMDP11532 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DMDP11532 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DMDP11532 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DMDP11532 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DMDP11532 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DMDP11532 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DMDP11532 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DMDP11532 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DMDP11532 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DMDP11532 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DMDP11532 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DMDP11532 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DMDP11532 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DMDP11532 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DMDP11532 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DMDP11532 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DMDP11532 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DMDP11532 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DMDP11532 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DMDP11532 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DMDP11532 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DMDP11532 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DMDP11532 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DMDP11532 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DMDP11532 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DMDP11532 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DMDP11532 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DMDP11532 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DMDP11532 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DMDP11532 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DMDP11532 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DMDP11532 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DMDP11532 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DMDP11532 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DMDP11532 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DMDP11532 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DMDP11532 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DMDP11532 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DMDP11532 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
DMDP11532 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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