Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD21O60216 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD21O60216 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD21O60216 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD21O60216 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD21O60216 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD21O60216 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD21O60216 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD21O60216 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD21O60216 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD21O60216 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD21O60216 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD21O60216 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD21O60216 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD21O60216 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD21O60216 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD21O60216 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD21O60216 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD21O60216 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD21O60216 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD21O60216 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD21O60216 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD21O60216 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD21O60216 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD21O60216 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD21O60216 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD21O60216 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD21O60216 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD21O60216 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD21O60216 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD21O60216 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD21O60216 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD21O60216 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD21O60216 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD21O60216 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD21O60216 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD21O60216 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD21O60216 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD21O60216 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD21O60216 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAD21O60216 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAD21O60216 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAD21O60216 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD21O60216 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD21O60216 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD21O60216 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD21O60216 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD21O60216 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD21O60216 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD21O60216 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD21O60216 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD21O60216 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD21O60216 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD21O60216 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD21O60216 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD21O60216 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD21O60216 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD21O60216 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD21O60216 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD21O60216 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD21O60216 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD21O60216 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD21O60216 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD21O60216 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD21O60216 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD21O60216 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD21O60216 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD21O60216 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD21O60216 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD21O60216 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD21O60216 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD21O60216 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD21O60216 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD21O60216 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD21O60216 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD21O60216 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD21O60216 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD21O60216 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD21O60216 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD21O60216 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD21O60216 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD21O60216 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD21O60216 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD21O60216 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD21O60216 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD21O60216 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD21O60216 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD21O60216 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD21O60216 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD21O60216 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD21O60216 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD21O60216 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD21O60216 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD21O60216 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD21O60216 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD21O60216 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD21O60216 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD21O60216 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD21O60216 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD21O60216 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms