Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GOLGA6L9A6NEM1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms