Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLF12Q9Y4X4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 397.2 ms