Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD3Q9UJU5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms