Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PNPLA3Q9NST1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PNPLA3Q9NST1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms