Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms