Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
BBS2Q9BXC9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BBS2Q9BXC9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms