Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC106Q9BWC9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.2 ms