Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPS25Q9BRG1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.4 ms