Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBF4Q9BQW3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBF4Q9BQW3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBF4Q9BQW3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBF4Q9BQW3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBF4Q9BQW3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBF4Q9BQW3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBF4Q9BQW3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBF4Q9BQW3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBF4Q9BQW3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBF4Q9BQW3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBF4Q9BQW3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EBF4Q9BQW3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EBF4Q9BQW3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EBF4Q9BQW3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EBF4Q9BQW3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EBF4Q9BQW3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms